腦干梗死發(fā)生是否能恢復以及恢復到怎樣的程度，與腦干發(fā)生梗死的面積大小有關系。如果腦干梗死面積小，患者的臨床表現(xiàn)輕，可能沒有嚴重的臨床癥狀，經(jīng)過治療病情穩(wěn)定后，經(jīng)過一定的康復訓練，促進神經(jīng)功能恢復，對于癥狀輕的患者是可以恢復的。
如果梗死的面積相對較大，神經(jīng)功能嚴重受損，而導致了嚴重的偏癱、腦神經(jīng)核損傷，還可能影響生命中樞而導致病情危重，可能出現(xiàn)呼吸衰竭。所以腦干梗死一旦出現(xiàn)，如果符合溶栓指征的應該及時溶栓，溶栓治療后大約30%左右的患者是可以良好恢復的。
對于腦干梗死已經(jīng)形成偏癱、或吞咽困難等顱神經(jīng)損傷的患者，在度過危險期后，病情穩(wěn)定后，經(jīng)過正規(guī)的康復訓練，一部分患者的癥狀也可以不同程度的恢復。