江西省胸科醫院始建于1950年，是由江西省結核病防治所、江西省肺科醫院轉型發(fā)展而來(lái)（1992年增掛“江西省肺科醫院”牌子，實(shí)行兩塊牌子一套人員；2004年2月更名為“江西省胸科醫院”，同年9月增掛“江西省第三人民醫院”牌子）；是全省唯一一所集醫療、預防、教學(xué)、科研為一體的以治療胸部疾病為主的“三級甲等”專(zhuān)科醫院。是南昌大學(xué)醫學(xué)院和江西中醫藥大學(xué)的教學(xué)醫院和研究生培養定點(diǎn)醫院。

醫院還承擔了全省結核病及其他傳染病的定點(diǎn)收治任務(wù)，是江西省突發(fā)公共衛生事件醫療救治中心；承擔了全省社區衛生技術(shù)工作的指導、培訓任務(wù)，為江西省社區衛生技術(shù)指導中心。2014年2月11日，經(jīng)省衛生廳批準獲得塵肺病診斷機構資格，成為江西省唯一獲得該資質(zhì)的三級甲等醫院。

醫院于2020年6月份被確立為江西省感染性疾病臨床研究中心；2020年9月確立為國家感染性疾病臨床中心江西分中心；2021年3月獲批江西省結核病專(zhuān)業(yè)質(zhì)量控制中心。 2021年8月江西省衛健委批復醫院為南昌醫學(xué)院直屬第三附屬醫院。

2020年9月份正式獲批為江西省公共衛生臨床中心。按照“醫防一體、平戰結合、防治融合”的原則，“平時(shí)”承擔全省感染性疾病診療、患者癥狀監測、疾病防治管理與健康宣教、公共衛生與應急管理、醫療物資儲備、教育培訓等公益事業(yè)職能；“戰時(shí)”轉化為重大疫情防控救治基地，擔負全省公共衛生事件應急救治職能。

2021年8月獲批南昌醫學(xué)院第三附屬醫院，促進(jìn)醫教研全方位發(fā)展。

醫院分兩個(gè)院區：疊山路院區和紅谷灘院區，醫院占地面積94.91畝，建筑面積3.7665萬(wàn)平方米，醫療用房3.1萬(wàn)平方米。設有胸外科、心血管內科、呼吸內科、腫瘤科、結核科、神經(jīng)內科等臨床醫技科室30個(gè)，職能科室23個(gè)，其中有1個(gè)院士工作站，3個(gè)省醫學(xué)領(lǐng)先學(xué)科，1個(gè)省醫學(xué)領(lǐng)先建設學(xué)科，1個(gè)國家衛計委呼吸內鏡培訓基地，1個(gè)國家中醫藥管理局重點(diǎn)研究室，一個(gè)省醫學(xué)會(huì )主委單位（結核病分會(huì )），5個(gè)研究型醫院主委單位（神經(jīng)感染與神經(jīng)免疫學(xué)分會(huì )、介入呼吸病學(xué)分會(huì )、胸部微創(chuàng )外科學(xué)分會(huì )、腫瘤分會(huì )、江西省保健學(xué)會(huì )肺血管介入學(xué)分會(huì )）。編制床位1000張，開(kāi)放病床800張；現有在職職工711人，其中正副教授、正副主任醫師120名，醫學(xué)博士7名，醫學(xué)碩士80余名，碩士生導師9名。江西省衛生系統高層次學(xué)術(shù)學(xué)科帶頭人1名，省衛生廳學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人培養對象15名。配備依柯達高能直線(xiàn)加速器、64排全身螺旋CT掃描機、直接數字化X線(xiàn)攝影機、大型數字減影C型臂、史塞克電子高清胸腔鏡、電子支氣管鏡、史托斯硬質(zhì)支氣管鏡、多功能進(jìn)口麻醉呼吸機、杜邦和日立全自動(dòng)生化儀、血氣分折儀、DNA擴增儀、細菌快速培養儀、彩色超聲診斷儀、肺功能儀、呼吸睡眠監測儀等先進(jìn)設備。

2021年獲批開(kāi)工的南昌九望新城新院區建設，總占地面積約為268畝，總投資25億，設置床位1950張，將全面定位以“江西省第三人民醫院為主，江西省公共衛生臨床中心為輔的”平臺建設，增設覆蓋內、外學(xué)科近15個(gè)新型臨床科室，利用3年左右時(shí)間建成主院區的門(mén)急診大樓、醫技大樓、綜合住院大樓、科研實(shí)驗大樓、行政綜合及配套設施部分工程；同時(shí)以重點(diǎn)學(xué)科建設同步進(jìn)行，利用5年左右時(shí)間將扶持重點(diǎn)學(xué)科專(zhuān)項突破，開(kāi)啟了“強專(zhuān)科、優(yōu)綜合”的特色發(fā)展新藍圖。

醫院堅持“科技興院”的理念，近年來(lái)獲省級科技成果獎13項，獲國內先進(jìn)水平的科研成果32項，填補省內空白16項，醫學(xué)專(zhuān)著(zhù)4部。胸外科、呼吸內鏡介入科、結核內科是江西省醫學(xué)領(lǐng)先學(xué)科，腫瘤學(xué)科是江西省醫學(xué)領(lǐng)先建設學(xué)科。呼吸科、心血管科、神經(jīng)危重癥學(xué)科是醫院重點(diǎn)建設學(xué)科。胸腔鏡微創(chuàng )外科手術(shù)、氣管支氣管鏡微創(chuàng )介入手術(shù)達國內先進(jìn)水平，難治性肺結核及耐多藥肺結核病人的治療技術(shù)處于省內領(lǐng)先水平。醫院內鏡中心2008年被衛生部授予“國家衛生部呼吸內鏡培訓基地”，2017年10月被中國醫師協(xié)會(huì )內鏡分會(huì )授予江西唯一、全國首批40家呼吸內鏡培訓基地之一。2019年1月呼吸與危重癥醫學(xué)科通過(guò)國家PCCM規范化建設項目診室評審，為三級達標單位；介入呼吸病學(xué)入選首批單修基地。2019年11月?tīng)款^成立了江西省呼吸介入專(zhuān)科醫聯(lián)體，面向全國進(jìn)行內鏡醫師培訓，年平均開(kāi)展氣管、支氣管介入手術(shù)1萬(wàn)例次，支氣管鏡檢查例數居全省之首。醫院率先引進(jìn)開(kāi)展了“大容量全肺灌洗術(shù)”，為廣大塵肺患者帶來(lái)福音，省內外塵肺患者慕名而來(lái)，滿(mǎn)意而歸。

醫院不斷深化醫改舉措， 加強科學(xué)管理，提高醫療質(zhì)量水平。2017年8月?tīng)款^組建了江西省結核病專(zhuān)科醫聯(lián)體，2017年9月加入了上海肺科醫院專(zhuān)科聯(lián)盟、北京胸科醫院創(chuàng )新聯(lián)盟及中日醫院呼吸專(zhuān)科醫聯(lián)體間質(zhì)性肺疾病協(xié)作組，充分優(yōu)化資源配置，形成上下聯(lián)動(dòng)、優(yōu)勢互補、資源共享的運行機制；作為中華社會(huì )救助基金會(huì )“大愛(ài)清塵”基金定點(diǎn)醫院，全力承擔起江西地區塵肺病患者的醫療救治工作； 2017年12月與中國工程院廖萬(wàn)清院士簽署成立致病真菌臨床醫學(xué)研究院士工作站，2019年11月正式掛牌“廖萬(wàn)清院士團隊工作室”，建立疑難真菌感染性疾病診療體系，共同提高為百姓健康服務(wù)的水平。2018年6月通過(guò)省衛計委專(zhuān)家評審，授予“第三周期醫院評審三級甲等醫院”稱(chēng)號。

醫院以“厚德、仁愛(ài)、專(zhuān)邃、為先”為院訓，堅持以“患者第一、質(zhì)量第一、服務(wù)第一”為宗旨，以精湛的技術(shù)、良好的醫德竭誠為廣大人民群眾提供優(yōu)質(zhì)的醫療保健服務(wù)。近年來(lái)，先后榮獲“江西省省級文明單位”、“江西省群眾滿(mǎn)意醫院”、“江西省衛生系統行風(fēng)建設優(yōu)良單位”、“廳直衛生系統社會(huì )治安綜合治理目標管理先進(jìn)單位”“全國百姓放心示范醫院”等稱(chēng)號。