須與急性阿米巴痢疾、細菌性胃腸型食物中毒及其他病原菌引起的急性腸道感染等鑒別。1.急性阿米巴痢疾病原是阿米巴原蟲(chóng)，多為散發(fā)性多不發(fā)熱，少有毒血癥狀，腹痛輕，無(wú)里急后重，腹瀉每日數次，多有右下腹壓痛，糞便量多典型者為暗紅色果醬樣血便，有腥臭，鏡檢白細胞少，紅細胞多，有夏-雷晶體，有溶組織阿米巴滋養體或包囊。2.細菌性胃腸型食物中毒由于進(jìn)食細菌及毒素污染的食物引起的，常見(jiàn)病原菌有沙門(mén)菌、變形桿菌、大腸桿菌及金黃色葡萄球菌等。有集體進(jìn)食同一食物及在同一潛伏期內集體發(fā)病的病史。有惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉等急性胃腸炎表現，大便多為稀水便，膿血便，里急后重少見(jiàn)。確診有賴(lài)于從病人嘔吐物、糞便及可疑食物中培養出同一病原菌。3.其他病原菌引起的腸道感染在痢疾樣腹瀉患者中，檢出非志賀菌的病原菌者占相當高的比例，如侵襲性大腸桿菌、鄰單胞菌、氣單胞菌及空腸彎曲菌等均不少見(jiàn)，其臨床表現與急性菌痢類(lèi)似。診斷有賴(lài)于糞便培養出不同的病原菌。4.其他還應與急性壞死性腸炎及腸套疊相鑒別。